国立人类学博物馆（National Museum of Anthropology）1964年建成开放，是墨西哥规模最大、参观人数最多的博物馆。该馆主要收藏和展示「前哥伦布时期」考古与人类学文物，以及墨西哥原住民相关文物，重要藏品包括阿兹特克日历石（Aztec sun stone）、阿兹特克索奇皮利雕塑（Aztec Xochipilli statue）等。
国立人类学博物馆共有2层24个展厅，包括22个常设展厅和2个临展厅，核心馆藏包括阿兹特克日历石、阿兹特克女神 Coatlicue 雕塑、提佐克石、火蛇（Xiuhcoatl）雕塑等。1层共有11个常设展厅，以「前哥伦布时期文明」为核心，按照不同地区分为北部、西部、墨西哥湾、瓦哈卡州、墨西哥城、玛雅文明、托尔特克文明、特奥蒂瓦坎文明，其他3个常设展厅分别为人类学引言、美洲人口、前古典时期。「人类学引言」展厅陈列一件露西（Lucy）化石骨架的复制品，露西由美国古人类学家 Donald Johanson 1974年发现，是迄今已知第一件非洲南方古猿骨架，被视为「人类最早的祖先」。「特奥蒂瓦坎文明」展厅将展出从该地区出土的考古文物，包括特拉洛克（Tlaloc）石雕、羽蛇神庙复制品等。「玛雅文明」展厅回顾了玛雅历史的形成与发展，这一文明在天文学、数学、艺术和文字领域都有很高成就，与印加帝国及阿兹特克并列为美洲三大文明。2层共有11个常设展厅，主要展示西班牙殖民统治下的墨西哥各地区的原住民文化。