捷克音乐博物馆（Czech Museum of Music）是捷克国家博物馆的一座分馆，致力于收藏、保存和研究中世纪迄今波西米亚地区的音乐文化。馆内现有藏品70万件，包括20万份乐谱档案、10万份录音录像、3000件乐器。
捷克音乐博物馆所在建筑落成于17世纪，最初是一座巴洛克式修道院教堂。1783年，神圣罗马帝国皇帝约瑟夫二世推行宗教改革，修道院遭解散，教堂则先后被改造为仓库、邮局等公共建筑。
1946年，捷克国家博物馆成立音乐部，专门保存乐器文物、乐谱档案和其他音乐相关藏品。1950年，音乐部在布拉格 Velkopřevorský 宫殿开放，在此基础上1976年正式建立了音乐博物馆。1991年，Velkopřevorský 宫殿的所有权被归还原主，布拉格政府决定将旧教堂建筑改造为博物馆。2004年，捷克音乐博物馆新馆正式对外开放。
捷克音乐博物馆的藏品总数达到70万件，包括20万份乐谱档案、10万份录音录像、7万份印刷品（音乐会海报、节目单等）、3.8万件艺术品、3000件乐器，以及大量书籍、手稿、照片、音乐家私人物品等。
博物馆常设展以人 - 乐器 - 音乐为主题，致力于介绍乐器的制作和工艺，展出的400件乐器按照演奏方式分为键盘乐器、弦乐器和管乐器三部分。
展品亮点包括17世纪意大利制琴师 Nicola Amati 制作的小提琴、18世纪奥地利制琴师 Franz Xaver Christoph 的钢琴、捷克作曲家 Alois Hába 设计的四分之一音钢琴等。
此外，捷克音乐博物馆还负责管理布拉格的3座小型场馆，分别用于纪念捷克音乐家 Antonín Dvořák、Bedřich Smetana 和 Jaroslav Ježek。